《表1 GST基因编码的蛋白质理化性质分析》
利用ProtParam在线分析工具分析LcGST基因编码的蛋白质氨基酸序列的理化性质,结果显示,羊草GST蛋白由碳、氢、氧、氮和硫5种元素组成,其分子式为C1141H1763N297O306S8,相对分子质量为24.78 kDa,理论等电点为5.81,其值小于7,表明羊草LcGST蛋白是一个弱酸性蛋白质(表1)。从氨基酸组成特点来看,GST蛋白包含20种常见氨基酸(表2),其中含量最高的为Leu(10.55%),其次为Glu(10.09%)和Val(10.09%),含量最低的为Asn(0.92%)和Thr(0.92%)。羊草GST蛋白其他理化特性如表1所示,其所带的电荷情况为负电荷残基数(Asp+Glu)为32,正电荷残基数(Arg+Lys)为28,脂溶性系数(AI)数值为90.74,不稳定系数(Instability index)数值为33.86。羊草GST蛋白的总平均亲水性(Grand average of hydropathicity,GRAVY)为-0.161,表明羊草GST蛋白应该属于亲水性蛋白。根据Protscale分析得到的亲/疏水信号图(图2)可知,GST蛋白C端含有疏水头部,N端为亲水头部,中间氨基酸靠近C端部分表现为亲水性,靠近N端部分表现为疏水性,其中以A29\\A30残基亲水性最强(-2.544),以A155残基疏水性最强(1.689)。整体看来,羊草GST蛋白的亲/疏水信号图中,峰值分布在-0.5以下的信号明显多于0.5以上的信号,这个结果也进一步证明羊草GST蛋白为亲水性蛋白。
图表编号 | XD00155147400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.31 |
作者 | 邢磊、郭园艺、汪自庆、麻鹏达 |
绘制单位 | 西北农林科技大学理学院、西北农林科技大学生命科学学院、西北农林科技大学理学院、西北农林科技大学生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |