《表1 虹鳟Hsp40基因理化性质》

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《虹鳟Hsp40家族基因鉴定及其热应激下的表达分析》


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经过同源性分析总共得到36个虹鳟Hsp40家族基因。根据斑马鱼命名指南(https://wiki.zfin.org/display/general/ZFIN+ebrafish+omenclature+uidelines)对鉴定出的Hsp40基因进行命名。所有的Hsp40家族基因分3种亚型(表1),分别为Ⅰ型(dnaja1,dnaja1L,dnaja2,dnaja2L1,dnaja2L2,dnaja2L3)、Ⅱ型(dnajb1a,dnajb1b,dnajb4,dnajb4L,dnajb5,dnajb6,dnajb6a,dnajb6b,dnajb6c,dnajb6d,dnajb6e,dnajb6f,dnajb6dL,dnajb6eL,dnajb6fL,dnajb11L,dnajb11)和Ⅲ型(dnajc3,dnajc3L,dnajc4,dnajc5,dnajc5b,dnajc7a,dnajc7b,dnajc11,dnajc14,dnajc17,dnajc17a,dnajc17b,dnajc28)。所有Hsp40基因分布于虹鳟26条染色体中的21条上,其中11号染色体上分布最多,有6个;其次是19号染色体,有4个;15号染色体有3个;2、9、13、20、22号染色体上各有2个;1、3、6、7、8、10、14、17、21、25、26、28、29号染色体上各有1个。所有Hsp40基因均定位到常染色体上,性染色体上没有发现Hsp40家族基因成员的存在。dnajc14蛋白序列最长,为706aa,最短的dnajc5b只有190 aa,分子量的变化与氨基酸长度的变化成正比,dnajc14的分子量最大,达到了78.08 kD,而dnajc5b的分子量最小,为21.65kD。等电点的变化范围较小,为5.01~9.09,其中22个呈碱性,14个呈酸性,说明虹鳟Hsp40的酸碱性差异比较大(表1)。鉴定出的所有Hsp40基因的总平均亲水性均为负值,即均为疏水蛋白。