《表4 Av BPPS启动子预测的顺式作用调控元件》
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《阳春砂3个萜类合酶基因启动子的克隆及其参与萜类调控的分析》
“+”链以转录起始位点左边第1个碱基的位置为-1;“*”当预测的TATA-box数目超过3个时,仅展示得分最高的3个,下表同
Av BPPS、Av LIS和Av HUS启动子序列的转录起始位点分别位于其起始密码子ATG上游59、23、389 bp处,截取转录起始位点上游序列,最终分别获得470、934、762 bp启动子序列。为了区分碱基的位置和正负链,从转录起始位点左边第1个碱基位置设为“-1”,依此类推。分别分析Av BPPS、Av LIS和Av HUS启动子顺式作用调控元件的类型、数量及位置。Av BPPS(图5-A)、Av LIS(图5-B)和Av HUS(图5-C)启动子均包含多个真核生物启动子保守元件,如TATA-box和CAAT-box。Av BPPS启动子中包含GCN4-motif(TGAGTCA)—参与胚乳表达的顺式作用调控元件,还有G-Box—与光响应的顺式作用调控元件,此外,还含有参与脱落酸反应、低温响应、MYB结合位点等顺式作用调控元件。预测得分(matrix score)超过5分的元件见表4。其中,GCN4-motif是本研究最为关注的顺式作用调控元件。
图表编号 | XD00215767200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.28 |
作者 | 赵海莹、李萌、林晓静、赵圆圆、梁慧琳、叶泽萍、杨锦芬 |
绘制单位 | 广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室(广州中医药大学)国家中成药工程技术研究中心南药研发实验室、广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室(广州中医药大学)国家中成药工程技术研究中心南药研发实验室、广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室(广州中医药大学)国家中成药工程技术研究中心南药研发实验室、广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室(广州中医药大学)国家中成药工程技术研究中心南药研发实验室 |
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