《表4 Av BPPS启动子预测的顺式作用调控元件》

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《阳春砂3个萜类合酶基因启动子的克隆及其参与萜类调控的分析》


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“+”链以转录起始位点左边第1个碱基的位置为-1;“*”当预测的TATA-box数目超过3个时,仅展示得分最高的3个,下表同

Av BPPS、Av LIS和Av HUS启动子序列的转录起始位点分别位于其起始密码子ATG上游59、23、389 bp处,截取转录起始位点上游序列,最终分别获得470、934、762 bp启动子序列。为了区分碱基的位置和正负链,从转录起始位点左边第1个碱基位置设为“-1”,依此类推。分别分析Av BPPS、Av LIS和Av HUS启动子顺式作用调控元件的类型、数量及位置。Av BPPS(图5-A)、Av LIS(图5-B)和Av HUS(图5-C)启动子均包含多个真核生物启动子保守元件,如TATA-box和CAAT-box。Av BPPS启动子中包含GCN4-motif(TGAGTCA)—参与胚乳表达的顺式作用调控元件,还有G-Box—与光响应的顺式作用调控元件,此外,还含有参与脱落酸反应、低温响应、MYB结合位点等顺式作用调控元件。预测得分(matrix score)超过5分的元件见表4。其中,GCN4-motif是本研究最为关注的顺式作用调控元件。