《表3 引物名称及序列:休眠期后板栗混合花芽的转录组分析》

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《休眠期后板栗混合花芽的转录组分析》


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利用转录组测序数据筛选及查阅相关文献,挑选出几个差异基因进行qRT-PCR分析,根据检测的基因表达量来验证转录组数据的可靠性。按照北京艾德莱生物科技有限公司的TRUEscript 1stStand cD-NA Synthesis Kit With g DNA Eraser试剂盒说明书合成cDNA第一链,采用2×SYBR Green qPCR Mix(With 100×ROX)试剂盒检测基因的表达量,选用Actin基因作为内参,用Primer 5.0设计引物(表3)。实验前先在2×SYBR Green qPCR Mix(1.25 m L)中加入2.5μL ROX Reference Dye,充分混匀后备用。qRT-P-CR反应体系25μL:2×SYBR qPCR Mix 12.5μL,cDNA模板1 ng,10 mmol/L正、反引物各0.5μL,补足ddH2O至25μL。将其放置于ABI 7500荧光定量PCR仪中,50℃孵育2 min;95℃预变性3 min;95℃15 s,60℃20 s,72℃30 s,循环40次。每个反应重复3次,采用2-ΔΔCt法对基因的表达量进行计算。