《表3 引物名称及序列:大口黑鲈IGFBP1基因SNPs的筛选及与生长性状的关联分析》
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《大口黑鲈IGFBP1基因SNPs的筛选及与生长性状的关联分析》
对已知的大口黑鲈转录组数据库(SRA436296)进行分析,得到IGFBP1的相关cDNA序列,同时分析NCBI数据库中其它物种相关信息,并主要参考花鲈(Lateolabrax japonicus)的该基因序列(JN692270.1)设计了8对引物(表3),送至广州艾基生物公司合成。最后筛选出合适引物,依次扩增获得大口黑鲈IGFBP1基因各片段,PCR反应体系包括20μL 2×Taq PCR master mix(TaKaRa,大连),上下游引物各1μL,模板DNA 1μL,加ddH2O使反应总体积达到40μL。PCR程序为预变性温度设置为94℃,时间4 min,再持续以下30个循环:变性温度94℃,时间30 s,退火温度55℃~58℃,30 s,延伸温度72℃,延伸30 s;循环结束后,相同温度下再延伸7 min结束程序。最终产物经1.2%琼脂糖凝胶电泳检测确认,产物测序工作交由广州艾基生物公司进行,测序结果返回后用Vector NTI Suite 11.0软件进行序列比对和组装及计算序列同源性,利用Mega 6.0软件的Neighbor-joining法构建系统进化树。
图表编号 | XD0088595500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.25 |
作者 | 李锐、李胜杰、白俊杰、姜鹏 |
绘制单位 | 内江师范学院,长江上游鱼类资源保护与利用四川省重点实验室、中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室、中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室、中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室 |
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