《表1 禾谷镰刀菌MYB转录因子分析》

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《禾谷镰刀菌MYB转录因子生物信息学分析》


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通过对真菌转录因子数据库(fungal transcription factor database,FTFD)进行搜索发现,禾谷镰刀菌含有17条MYB转录因子序列,分别命名为Fg MYB01~Fg MYB13,由于其余4个已经被报道(Kim et al.,2014;Son et al.,2014),这里延用了它们被鉴定时的名称MYT1、MYT2、MYT3和Fg FlbD(表1)。序列分析显示,17个MYB转录因子的核酸长度介于6 915 bp和678 bp之间,对应最长和最短的转录因子分别为MYT3和Fg MYB05,编码蛋白大小分别为2 304 aa和225 aa,分子量分别为256 635.86 kD和24 651.97 kD(表1)。理化性质分析发现,17个MYB转录因子的理论等电点介于10.17和4.85之间,对应最大和最小的转录因子分别为Fg MYB09和Fg MYB05;原子总数介于35 416和3 452之间,对应最多和最少的转录因子分别为MYT3和Fg MYB05;脂肪系数介于75.84和43.11之间,对应最大和最小的转录因子分别为Fg MYB012和Fg MYB06;不稳定系数介于84.09和42.69之间,对应最大和最小的转录因子分别为Fg MYB01和Fg MYB03(表1)。这些数据说明禾谷镰刀菌17个MYB转录因子在核酸序列长度、编码蛋白大小以及等电点等理化性质方面具有差异。