《表1 苦荞中已报道的MYB转录因子及其功能》

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《苦荞MYB家族转录因子研究进展》

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根据苦荞基因组、转录组文献报道，目前已发现MYB家族转录因子共170个，包括R2R3-MYB型转录因子149个，3R-MYB型转录因子8个，4R-MYB型转录因子1个以及未分类的12个。其中R2R3-MYB型转录因子最多，可进一步划分为25个亚组（subgroup，SG）[37]。本文总结了苦荞MYB转录因子研究的相关文献，发现已有功能报道的MYB家族转录因子共有18个，其中15个转录因子在NCBI可检索到基因号和完整的基因序列，3个基因序列未知，见表1。为了进一步了解这些MYB转录因子的相互聚类关系，本研究将已知序列的15个苦荞MYB家族转录因子与拟南芥MYB家族转录因子进行聚类分析，见图1。15个苦荞已知序列的MYB家族转录因子与拟南芥MYB家族转录因子的聚类分析。NJ树构建采用邻接法（bootstraps=1 000）。MYB家族的分类参考拟南芥[50-51]。NJ树分析结果表明，15个MYB转录因子均属于R2R3-MYB亚家族，其中12个基因FtMYB1，FtMYB2，FtMYB7（KM588379），FtMYB7（KT285529），FtMYB9（KM588380），FtMYB10，FtMYB11，FtMYB13，FtMYB14，FtMYB15，FtMYB17，FtMYB21分别聚类在SG1，SG3，SG4，SG7，SG13，SG20，SG22这7个亚组；3个基因FtMYB3，FtMYB9（KT285530），FtMYB12暂未被分类；文献中的2个FtMYB7和2个FtMYB9转录因子虽命名相同，但基因序列不同，属于不同的亚组。通过聚类分析，笔者进一步明确了已报道的苦荞MYB家族转录因子分属亚组类型及其相互关系，为苦荞MYB家族基因的下一步研究提供参考。