《表1 6株与最相似菌株相似性小于95%的分离菌株》

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《南海孔石藻可培养细菌多样性及代谢产物四溴吡咯研究》

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本实验从孔石藻共分离获得369株细菌，16S rRNA基因序列的比对结果显示，可培养细菌分属于3个门、5个纲、12个目、22个科、47个属的97个物种。其中，变形菌门（Proteobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes）为优势类群，分别占79.4%和20.3%，厚壁菌门（Firmicutes）仅有1株细菌。5个纲分别为α‐变形菌纲（Alphaproteobacteria）、γ‐变形菌纲（Gammaproteobacteria）、黄杆菌纲（Flavobacte‐ria）、噬纤维菌纲（Cytophagia）和芽胞杆菌纲（Bacil‐li），分别占47.4%、32.0%、19.2%、1.1%和0.3%。在属级水平，丰度最高的5个类群为假交替单胞菌属、海水菌属（Aquimarina）、鲁杰氏菌属（Ruegeria）、假弧菌属（Pseuvibrio）和弧菌属（Vibrio）（图2）。分离细菌最多的假交替单胞菌属共有63株细菌，分属于7个种，其中深红假交替单胞菌（Pseudoalteromonas rubra)21株、海绵假交替单胞菌（P.spongiae)18株、金黄色假交替单胞菌（P.flavipulchra)10株、藤黄紫假交替单胞菌（P.luteoviolacea)5株、苯酚假交替单胞菌（P.phenolica)5株、海盗假交替单胞菌（P.piratica)3株、杀鱼假交替单胞菌（P.piscicida)1株。另外，分离获得的369株细菌中，16S rRNA基因序列相似性高于98%的有272株（73.7%），相似性95%～98%的有91株（24.7%），低于95%的有6株（1.6%）（表1），表明孔石藻具有较丰富的微生物新物种资源。