《表3 R.radiobacter菌株与模式菌株atpD、glnII和recA基因合并序列相似性》

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《紫花苜蓿根瘤菌分子分型和生物型划分研究》

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注:相似性值和菌株种名由合并序列系统发育树决定（参考图3）。Note:Similarity and bacterial species was determined based on the position of a given strain in the phylogenetic tree（reference Fig.3）.

对20个菌株的持家基因atpD、glnII和recA进行测序分析，结果如图2所示。基于atpD（图2a）、glnII（图2b）和recA（图2c）系统发育树的拓扑结构表明菌株的系统发育地位不稳定，虽然所有菌株在3个系统发育树中均形成8个分支，但是菌株的进化地位存在差异。单个的持家基因系统发育分析不足以准确地对供试菌株进行分类。因此，对于持家基因合并序列进行了MLST分析，建立了20个菌株和参比菌株的系统发育树。如图3和表3所示，菌株G3T1、G3P2、WLG2、WLL3、WLJ3、WLL2、WLL4、LT2、WLL5、WTT4、WLN3和LP4与模式菌株R.radiobacter CCBAU 75229T聚在一起；菌株G9TT1、G9TT5、G9TT2和LT3与模式菌株R.radiobacterCCBAU 75204T聚在一起；菌株G9TT4、G3L1、G3G1和G3G2分别与模式菌株R.radiobacter CCBAU 75221T、R.radiobacter HAMBI 1814T、R.radiobacter CCBAU 73262T和R.radiobacter LMG 140T聚在一起。所有菌株序列相似性≥97%。经过持家基因合并序列MLST分析，20个菌株被定种为R.radiobacter（表3）。