《表1 碱基质量值与碱基识别出错的概率对应关系》

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碱基质量值(quality score)是碱基识别(base calling)出错的概率的整数映射。通常使用Phred质量评估公式。剪辑质量值越高表明碱基识别越可靠,碱基测错的可能性越小。表1对于碱基质量值为Q20的碱基识别,100个碱基中有1个会识别出错;对于碱基质量值为Q30的碱基识别,1 000个碱基中有1个会识别出错;对于碱基质量值为Q40的碱基识别,10 000个碱基中有1个会识别出错。以测序循环为单位,对单个样本所有序列平行测序的剪辑质量值做分布图,可以查看单个样本各个测序循环及整体的测序质量。图1为转录组碱基质量分布图,图中碱基质量值大于20表示碱基测序准确度大于99%,可用于后续分析。