《表1 碱基质量值与碱基识别出错的概率对应关系》
碱基质量值(quality score)是碱基识别(base calling)出错的概率的整数映射。通常使用Phred质量评估公式。剪辑质量值越高表明碱基识别越可靠,碱基测错的可能性越小。表1对于碱基质量值为Q20的碱基识别,100个碱基中有1个会识别出错;对于碱基质量值为Q30的碱基识别,1 000个碱基中有1个会识别出错;对于碱基质量值为Q40的碱基识别,10 000个碱基中有1个会识别出错。以测序循环为单位,对单个样本所有序列平行测序的剪辑质量值做分布图,可以查看单个样本各个测序循环及整体的测序质量。图1为转录组碱基质量分布图,图中碱基质量值大于20表示碱基测序准确度大于99%,可用于后续分析。
图表编号 | XD00142559900 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.02.28 |
作者 | 覃福礼、赵亮、周艳卿、周瑾、须秋萍、李群英、焦杨 |
绘制单位 | 广西医科大学药学院药理教研室、上海市宝山区罗店医院药剂科、上海市宝山区罗店医院药剂科、上海市宝山区罗店医院药剂科、上海市宝山区罗店医院药剂科、上海市宝山区罗店医院药剂科、广西医科大学药学院药理教研室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |