《表2 都柳江南方白甲鱼群体mt DNA D-loop核心识别序列碱基组成》

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《都柳江南方白甲鱼群体mtDNA D-loop序列及遗传多样性分析》


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经过比对分析,获得南方白甲鱼mtDNA D-loop序列长度分别为686~687 bp的碱基序列。结果表明,都柳江南方白甲鱼mtDNA D-loop序列的4种碱基的含量为A+T含量高于C+G含量,以G含量最低。同时识别了都柳江南方白甲鱼群体D-loop序列的终止序列区(terminal associated sequences,ETAS)、中央保守区(central conserved domain,CD)和保守序列区(conserved sequence block,CSB)及相关保守序列。都柳江南方白甲鱼群体D-loop序列的终止序列区、中央保守区和保守序列区的碱基A、T含量明显较高(表1)。南方白甲鱼群体的终止序列区序列(ETAS)长度为246 bp。在终止序列区中,发现2个与DNA复制终止相关序列TAS(TACAT)及2个TAS反向互补序列ATGTA(表2)。都柳江南方白甲鱼群体D-loop序列中央保守区(CD)长度为318~319 bp,识别了CSB-D、CSB-E和CSB-F。保守序列区(CSB)长度为122 bp,识别了CSB-1,但未识别出CSB-2和CSB-3(表2)。