《表2‘火炬’枇杷基因组测序结果》

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《应用枇杷二代测序数据进行染色体步移研究》

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使用CL15890.Contig2（细胞壁扩展蛋白EjEXP3）为测试基因，从枇杷转录本文库中找到该基因的序列，使用前端100 bp序列建立Magicblast文库并进行检索。测试的‘火炬’枇杷二代测序数据超过60 GB，整个数据的完全检索需要花费超过5 h，所以运行0.5 h后手动终止，获得部分检索结果。序列拼接后往前延伸，根据新序列建立新文库，循环延伸直至启动子区域超过2 000 bp。整个检索过程总共获得147个匹配Reads，拼接19次，耗时9.5 h。