《表3 苹果NLP蛋白质二级结构》

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《苹果NLP(Nin-Like Protein)转录因子基因家族全基因组鉴定及表达模式分析》

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对MdNLP蛋白进行二级结构预测，从表3看出，6个蛋白质二级结构都以无规卷曲和α螺旋为主，其中无规卷曲占到最大比例，此外二级结构中还包含β转角，所占比例都是最小的，而且在这些蛋白质中各二级结构所占比例大致相似。为了比较苹果NLP蛋白中3种结构域（GAF-like、RWP-RK、PB1）的结构特征，本次研究采用同源建模的方法绘制出保守区段的三维蛋白模型（图3）。通过比较这些模型，很直观地观察到苹果NLP蛋白保守域结构的高度相似性，而往往特定结构与特殊功能相关联，对此猜测苹果中NLP家族的功能离不开这些区域。此外，注意到MdNLP1蛋白的PB1区段发生缺失，由于缺失序列较长，无法模拟出三级结构，这导致了其功能相较于其他家族成员可能会出现差异。