《表3 苹果蔗糖转运蛋白二级结构信息》

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《苹果蔗糖转运蛋白基因的生物信息学分析》


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注:括号外数字表示不同二级结构的氨基酸数量,括号内数字表示不同二级结构的氨基酸百分比。

上述6个全长序列均无信号肽和N-糖基化位点,但存在1~8个O-糖基化位点。苹果蔗糖转移酶蛋白序列的中部亲水胞质环将该蛋白序列分为前后2个半区,SUT1-like2的前半区含有5个跨膜区,后半区含有6个跨膜区;SUT2-like1和SUT2-like2前半区含有5个典型跨膜区和1个疑似跨膜区(序列具有较高可能性,但未达阈值),后半区含有6个跨膜区;而SUT1-like1,SUT4-like1和SUT4-like2的前、后半区均含有6个跨膜区(图2)。上述6个蛋白二级序列中,α-螺旋占比最大(42.56%),无规则卷曲次之(38.15%),β-折叠占比相对较少(15.35%),β-转角占比最少(3.95%)(表3) 。