《表2 DNA条形码引物信息》

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《蓝莓栽培品种的DNA条形码》


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取硅胶干燥的蓝莓叶片约30 mg,用植物基因组DNA提取试剂盒(北京庄盟)提取蓝莓总DNA,具体操作详见说明书。提取的总DNA于-20℃保存备用。选用rpoB、psbA-trnH、ycf5、rbcL、rpoC、mat K、ITS、ITS2(Liu et al.,2012;CBOL Plant Working Group,2009)条形码进行PCR扩增,引物信息见表2。PCR反应体系30μL,包括2×Taq PCR Master Mix(庄盟生物)15μL,浓度为10μmol·L-1的上、下游引物各0.75μL,ddH2O 12μL,模板DNA 1.5μL。各条形码优化后反应程序如下:(1)ITS2反应程序:95℃5 min;95℃20 s,58℃20 s,72℃40 s,30循环;12℃保存。(2)psbA-trnH、rpoC反应程序:95℃5 min;95℃20 s,56℃20 s,72℃40 s,30循环;12℃保存。(3)rbcL反应程序:95℃5 min;95℃20 s,56℃20 s,72℃1 min,30循环;12℃保存。(4)rpoB反应程序:95℃5 min;95℃20 s,48℃20 s,72℃1 min,30循环;12℃保存。(5)matK反应程序:95℃5 min;95℃20 s,48℃20 s,72℃1 min,5循环;95℃20 s,53℃20 s,72℃1 min,25循环;12℃保存。