《表2 所用引物序列:5种楠木木材DNA的提取与条形码鉴定》

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《5种楠木木材DNA的提取与条形码鉴定》


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选取4段DNA条形码作为候选条形码,分别是叶绿体基因组上的matK基因片段、rpoB基因片段、trnL-trnF片段(trnL基因与trnF基因之间的非编码区序列)和trnL-intro(trnL基因内含子区)。以各样品的木材总DNA为模板,分别以4段DNA条形码的对应引物进行PCR扩增,引物序列见表2。反应体系(25μL)为:10×Pfu Buffer with MgSO4 2.5μL,Pfu DNA聚合酶(2.5 U/μL)0.5μL,正反向引物(10μmol/L)各1μL,模板DNA 1μL,无核酸酶水19μL。反应程序如下:94℃预变性5 min,接着每个循环94℃变性30 s,54℃退火30 s,72℃延伸1 min,共35个循环,最后72℃延伸10 min。PCR产物首先采用1%琼脂糖凝胶电泳进行检测,然后采用Biospin PCR产物纯化试剂盒对PCR产物进行纯化,纯化后的PCR产物送至北京六合华大基因科技股份有限公司进行测序。