《表2 基于7个叶绿体通用DNA条形码片段的特征信息》

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《川芎种质鉴定标记开发和系统发育研究》


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所选用的7个通用DNA条形码片段的序列特征信息见表2。对于的26份藁本属材料,结合Genbank数据库中已发表的其他藁本属序列基因序列结果进行对比分析,比对结果显示matK、rpoB、rpoC1、ycf1、rbcL、psbA-trnH和trnK序列比对后总长度分别为542、340、504、908、523、157和1 220个核苷酸,平均GC含量分别为35.9%、40.5%、41.7%、33.0%、44.9%、33.1%和32.5%,变异位点为7.38%、46.47%、73.41%、51.32%、2.62%、51.59%和1.97%。遗传发育的信息位点比例分别为3.50%、0.002%、48.41%、50.44%、2.25%、39.49%和1.07%。在7个单个通用条形码序列片段中,rbcL片段的保守位点最多,rpoC1片段的保守位点最少、变异位点最多,ycf1片段的信息位点最多,rpoB的自裔位点最少,rbcL片段的GC含量最高。