《表5 不同引物片段组合对藁本属植物的遗传距离分析》

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《川芎种质鉴定标记开发和系统发育研究》


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对7个通用DNA条形码序列片段种间和种内的K2P遗传距离进行统计分析,通过对单个通用DNA条形码片段的种内、种间序列变异分布进行Wilcoxon秩和检验,发现rpoC1序列的种内、种间序列变异最为显著(表3)。同时,7个通用DNA条形码序列片段的种间遗传距离平均值均大于种内遗传距离平均值。rbcL序列片段具有最小的平均种间遗传距离和平均种内遗传距离,分别为0.003 1和0.002 5。psbA-trnH具有最大的平均种间遗传距离,遗传距离值0.429 2,其余依次为rpoC1、ycf1、rpoB、trnK和matK。rpoC1的平均种内遗传距离为0.256 1,具有最大的平均种内遗传距离,其次是ycf1、rpoB、psbA-trnH、trnK、matK(表4)。在15组引物组合序列片段中,种间遗传距离平均值均大于种内遗传距离平均值,rbcL+rpoB具有最小的平均种间遗传距离和平均种内遗传距离分别为0.001 8和0.001 6。matK+rpo B+rpo C1具有最大的平均种间遗传距离0.034 0,rbcL+rpoB+rpoC1具有最大的平均种内遗传距离0.031 3(表5)。