《表1 荧光定量PCR引物》
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《基于高通量测序对人胃癌组织长链非编码RNA差异表达的分析》
为验证芯片结果的可靠性,重新提取30对胃癌患者癌组织与癌旁组织,对部分差异表达的lncRNA进行定量反转录聚合酶链反应(quantitative reverse transcription polymerase chain reaction,qRT-PCR)验证。挑选芯片结果中表达最高和最低以及转录因子-lncRNA网络图中关键的5个lncRNA。按照说明书使用PrimeScript RT试剂盒(RR037A,日本TaKaRa)将每种RNA反转录成cDNA,然后使用SYBR Premix Ex Taq TM试剂盒(RR820A,日本TaKaRa)进行qRT-PCR,内参为GAPDH。使用2-ΔΔCt法计算候选lncRNA的相对表达量。其中PCR引物由上海生工生物公司设计,引物序列见表1。
图表编号 | XD00111052300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.28 |
作者 | 余志龙、戎泽印、罗再、章建明、黄陈 |
绘制单位 | 上海交通大学附属第一人民医院普通外科、上海交通大学附属第一人民医院普通外科、上海交通大学附属第一人民医院普通外科、上海交通大学附属第一人民医院普通外科、上海交通大学附属第一人民医院普通外科 |
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