《表1 叶绿素合成相关基因的引物序列》

《表1 叶绿素合成相关基因的引物序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《彩叶香樟叶片色素含量及其合成相关基因表达的变化》


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CHLH:Mg-螯合酶H亚基;CHLI:Mg-螯合酶I亚基;CHLD:Mg-螯合酶D亚基;HEMA:谷氨酰-t RNA还原酶;GSA:谷氨酸酯-1-半醛2,1氨基变位酶;HEMC:胆色素原脱氨酶;HEMD:尿卟啉原III合成酶;HEME:尿卟啉原Ⅲ脱羧酶;HEMF:粪卟啉原Ⅲ氧化酶;HEMG:原卟啉原氧化酶;CHLM:Mg-原卟啉

在叶片颜色相关测定进行的同时,采集'涌金'与野生香樟树冠中上部当年生叶片各12片,经液氮速冻后于-80℃冰箱保存备用。利用十六烷基三甲基溴化铵(hexadecyl trimethyl ammonium bromide,CTAB)法提取叶片总RNA,使用NanoDrop微量分光光度计(Thermo公司,美国)测定RNA的纯度和浓度,经1%的琼脂糖凝胶电泳检测其完整性。参照PrimeScript?RT reagent Kit(TaKaRa公司,大连)反转录试剂盒的说明书合成cDNA。根据叶绿素合成酶相关基因的注释(王平荣等,2009),结合课题组已有香樟转录组数据库,查找库中与叶绿素合成酶相关的基因序列,并利用Oligo7.0设计qRT-PCR的引物。所设计的引物由南京金斯瑞生物科技有限公司合成,引物序列见表1。使用SYBR?Premix Ex TaqTMTliRNAseH Plus(TaKaRa公司,大连)和PrimeScript?Reagent Kit(TaKaRa公司,大连)的试剂与荧光定量PCR仪(Bio-Rad公司,美国)进行q RT-PCR的检测,每个样品3个重复。qRT-PCR反应总体系为10μL:SYBR Premix Taq(1×)5μL,上、下游引物(0.2μmol/L)各0.2μL,cDNA(100 ng/μL)1μL,ddH2O 3.6μL,扩增程序为95℃30 s,95℃5 s,61℃30 s,40个循环,65℃5 s,95℃5 s。以CcACTIN1作内参基因,以4月10日的野生香樟的作为参照组,采用2-ΔΔCt法分析qRT-PCR结果并计算'涌金'与野生香樟表达差异,相关计算在CFX96Manager?V 1.6上完成。