《表1 单源指示物法常用的基因标记及其引物》

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《水环境微生物溯源技术的研究和应用进展》

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注：*R=TP/（TP+FN），其中TP（真阳性）表示特异性PCR引物对目标种属的样品进行扩增显示阳性的样本数；FN（假阴性）表示特异性PCR引物对目标种属的样品进行扩增显示阴性的样本数。#S=TN/（TN+FP），其中TN（真阴性）表示特异性PCR引物对非目标种属的样品进行扩增显示阴性的样

双歧杆菌为专性厌氧菌，在人类肠道内的浓度很高，并且在环境中难以繁殖[20]，所以通常不会出现在无污染的环境水体中。有些山梨醇发酵双歧杆菌（Sorbitolfermenting Bifidobacteria，SFB）（如B.adolescentis和B.breve）可作为人类粪便污染的指示物[21-22]。SFB可通过用含有山梨醇的琼脂培养基进行培养鉴定[23]，但有研究表明基于SFB培养的MST方法的特异性并不高[24]。相比之下，利用不依赖于培养的分子检测方法，主要是基于PCR的方法，能够区分不同宿主类型中的不同双歧杆菌基因型。例如，Balleste等[25]发现在人类、禽类和牛的粪便样品中存在不同类型的双歧杆菌16S rRNA基因片段且可作为宿主特异性基因标记来指示特定来源的粪便污染。一些研究还建立了基于宿主特异性双歧杆菌16S rRNA基因标记的qPCR方法[26-27]（表1），能够进一步定量区分污染来源。