《表1 土壤微生物组研究方法的特征对比》

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《施肥影响土壤性状和微生物组的研究进展》


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扩增子高通量测序和宏组学技术凭借其数据量大、避开培养过程、囊括信息全面等优点为土壤微生物组的研究揭开了新篇章。16S rRNA基因的高通量测序和系统发育分析为微生物群落的现代研究奠定了基础[14]。包括宏基因组学、宏转录组学、宏蛋白组学、宏代谢组学在内的宏组学技术分别在DNA、RNA、蛋白质、代谢水平上来反映土壤微生物组成及群落结构,不同水平上的测序手段存在其各自的利弊,详细信息见表1。珂博和张彤团队在近期联合多维宏组学(宏基因组、宏转录组及目标性代谢组学)解析了混合微生物群落内细菌间协同代谢关系[15]。除此之外,高通量基因芯片GeoChip也用于分析微生物群落的功能多样性、组成、结构、代谢潜力/活性和动态[16]。