《表1 细菌、真菌的PCR扩增引物设计》
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《基于下一代测序分析3种不同保鲜处理的香椿在贮藏期间微生物多样性变化》
对细菌16S rDNA的V57区域和真菌的ITS 1区域进行扩增,根据测序区域的选择,使用表1所示的特异引物。聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)反应体系(30μL):Phusion Master Mix(2×)15μL,Primer(2μmol/L)3μL(6μmol),gDNA(1 ng/μL)10μL(5 ng~10 ng),H2O2μL。反应程序:98℃预变性1 min;30个循环包括(98℃,10 s;50℃,30 s;72℃,30 s);72℃,5 min。PCR产物使用2%浓度的琼脂糖凝胶进行电泳检测,根据PCR产物浓度进行等浓度混样,充分混匀后使用1×TAE浓度为2%的琼脂糖胶电泳纯化PCR产物,然后割胶并使用GeneJET胶回收试剂盒回收目标条带。使用New England Biolabs公司的NEB NextRUltraTMDNA Library Prep Kit for Illumina建库试剂盒进行文库的构建,构建好的文库经过Qubit定量和文库检测,合格后,使用HiSeq进行上机测序。
图表编号 | XD0094085100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.20 |
作者 | 林少华、陈存坤、张慧杰、罗红霞、王丽琼、崔梦娇、许文涛、邓毛程 |
绘制单位 | 北京农业职业学院食品与生物工程系、国家农产品保鲜工程技术研究中心(天津)天津市农产品采后生理与贮藏保鲜重点实验室、天津科技大学食品工程与生物技术学院食品营养与安全省部共建教育部重点实验室、北京农业职业学院食品与生物工程系、北京农业职业学院食品与生物工程系、广东轻工职业技术学院食品与生物技术学院广东高校特色调味品工程技术开发中心、中国农业大学食品科学与营养工程学院食品营养与人类健康高精尖创新中心、广东轻工职业技术学院食品与生物技术学院广东高校特色调味品工程技术开发中心 |
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