《表1 细菌、真菌的PCR扩增引物设计》

《表1 细菌、真菌的PCR扩增引物设计》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《基于下一代测序分析3种不同保鲜处理的香椿在贮藏期间微生物多样性变化》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

对细菌16S rDNA的V57区域和真菌的ITS 1区域进行扩增,根据测序区域的选择,使用表1所示的特异引物。聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)反应体系(30μL):Phusion Master Mix(2×)15μL,Primer(2μmol/L)3μL(6μmol),gDNA(1 ng/μL)10μL(5 ng~10 ng),H2O2μL。反应程序:98℃预变性1 min;30个循环包括(98℃,10 s;50℃,30 s;72℃,30 s);72℃,5 min。PCR产物使用2%浓度的琼脂糖凝胶进行电泳检测,根据PCR产物浓度进行等浓度混样,充分混匀后使用1×TAE浓度为2%的琼脂糖胶电泳纯化PCR产物,然后割胶并使用GeneJET胶回收试剂盒回收目标条带。使用New England Biolabs公司的NEB NextRUltraTMDNA Library Prep Kit for Illumina建库试剂盒进行文库的构建,构建好的文库经过Qubit定量和文库检测,合格后,使用HiSeq进行上机测序。