《表1 PCR扩增细菌16S r RNA基因的引物》
按照细菌基因组DNA提取试剂盒说明书,提取分离菌基因组DNA。采用赵鹤庭等扩增细菌16S r RNA基因鉴定细菌种属分类的方法及引物[8](表1)。P C R反应体系(2 5μL):2×Ta q P C R Master Mix 12.5μL,dd H2O 9.5μL,上游引物(10μmol/L) 1μL,下游引物(10μmol/L) 1μL,DNA模板1μL。PCR反应条件:93°C 3 min;93°C 30 s,55°C 30 s,72°C 30 s,进行35个循环;72°C 7 min;4°C保存。PCR产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳检测。表1中所有引物的PCR反应体系和反应条件相同。将分离菌株的16S r RNA基因分成首尾重叠的3个片段进行扩增,PCR产物纯化后用相应的扩增引物进行双向测序,结果采用Vector NTI软件拼接,得到大约1 450 bp的细菌16S r RNA基因序列。所得序列提交Gen Bank进行BLAST比对,确定细菌的种属分类。利用MEGA6.0软件构建分离菌进化树。引物合成及PCR产物测序由昆明硕擎生物有限公司完成。
图表编号 | XD00210326400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.20 |
作者 | 李廷翠、严红亚、常志顺、李珂、覃袖伟、赵蓉、信爱国 |
绘制单位 | 云南省畜牧兽医科学院、云南农业大学动物医学院、云南省畜牧兽医科学院、云南省畜牧兽医科学院、云南省畜牧兽医科学院、云南省畜牧兽医科学院、云南省畜牧兽医科学院、云南省畜牧兽医科学院 |
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