《表2 PCR扩增引物与限制性内切酶片段多态性位点实验设计》
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《人类ErbB2转录因子1基因多态性与陕西汉族人群胃癌的关系研究》
注:F为正向引物,R为反向引物。
本研究使用https://www.ncbi.nlm.nih.gov网站筛选TOB1基因SNP位点,以中国汉族人群数据库最小等位基因频率>0.05为筛选标准,结合相关研究[9],选定17号染色体rs61482741(NM 001243877)、rs34700818(NM 001243877)、rs12601477(NM 001243877)、rs4626(NM 001243877)为本次研究候选SNP位点。采用Primer Premier 5软件设计PCR扩增引物;在https://genome.ucsc.edu网站使用In-Silico PCR软件验证各SNP位点PCR扩增引物特异性。PCR扩增引物委托上海生工生物科技有限公司合成。在http://watcut.uwaterloo.ca网站使用SNP-RFLP analysis软件筛选4个SNP位点限制性片段长度多态性(RFLP)内切酶位点;限制性内切酶Eam1104I(rs61482741,货号:FD0234)、Csp6I(rs34700818,货号:FD0214)、TaiI(rs12601477,货号:FD1144)、Alw26I(rs4626,货号:FD0034)购于Thermo ScientificTM公司。见表2。
图表编号 | XD00156028700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.30 |
作者 | 李晓波、范志刚、李婷、白素琴、张清雯 |
绘制单位 | 西安交通大学医学院附属3201医院微生物免疫检验科分子诊断实验室、西安交通大学医学院附属3201医院肿瘤内科一病区、西安交通大学医学院附属3201医院临床医学检验科、西安交通大学医学院附属3201医院微生物免疫检验科分子诊断实验室、西安交通大学医学院附属3201医院微生物免疫检验科分子诊断实验室 |
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