《表1 C1GALT1基因SNP的引物和限制性内切酶》

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《C1GALT1基因变异与IgA肾病遗传易感性的相关性研究》


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通过ht SNPer1.0选择常见SNP(具有次要等位基因频率>10%的SNP)作为htSNP。根据单倍型多样性进行软件应用,在一个模块中,这个定义要求htSNPs应该解释多样性不低于0.8的阈值。在C1AGLT1基因中,5个标记SNP,被命名为SNP1(-734C/T),SNP4(-465A/G),SNP6(-330G/T),SNP7(-292C/-)和SNP8(1365G/A)进行进一步分析。通过定向测序对SNP8进行基因分型,并且通过标准PCR-限制性片段长度多态性方法在所有1 160个受试者中对另外4个SNP进行基因分型。表1列出了引物和限制性核酸内切酶。每个SNP位点的40个PCR产物被重新测序以准确确认PCR限制性片段长度多态性分析。