《表1 RNA序列同猪基因组比对的情况》
参考猪基因组(Sus_scrofa.Sscrofa10.2.75.dna.toplevel.fa)对所得转录组信息进行比对,6头大白猪的有用序列分别是39 140 446,34 727 864,46 805 256,34 616 340,97 990 574,98 111 438条。比对成功序列分别是33 148 433,29 155 092,39 414 297,29 233 982,84 774 072,86 084 776条,比对成功的比例分别达到84.69%、83.95%、84.21%、84.45%、86.51%、87.74%,说明转录组测序质量较高,80%以上的有用序列都能比对到基因组上。其中仅比对一次的独特比对序列比例分别为92.60%、92.44%、92.24%、92.64%、91.48%、91.07%(见表1),说明绝大多数基因序列具有独特性。冷舍中2头猪肝脏基因转录的RNA比对序列数和比对到基因组上的RNA序列数普遍比暖舍猪肝脏高2倍以上,说明低温对猪肝脏中的基因转录影响明显。
图表编号 | XD0089312600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.10 |
作者 | 刘自广、刘娣、王文涛、郭镇华、汪亮、田明、彭福刚、付博、吴赛辉、钟荣珍、房义、胡娟、何鑫淼、肖龑 |
绘制单位 | 农业农村部种养结合重点实验室、黑龙江省农业科学院畜牧研究所、农业农村部种养结合重点实验室、黑龙江省农业科学院畜牧研究所、农业农村部种养结合重点实验室、黑龙江省农业科学院畜牧研究所、农业农村部种养结合重点实验室、黑龙江省农业科学院畜牧研究所、农业农村部种养结合重点实验室、黑龙江省农业科学院畜牧研究所、农业农村部种养结合重点实验室、黑龙江省农业科学院畜牧研究所、农业农村部种养结合重点实验室、黑龙江省农业科学院畜牧研究所、农业农村部种养结合重点实验室、黑龙江省农业科学院畜牧研究所、农业农村部种养结合重点实验室、 |
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