《表1 靶向USE1基因的RNA干扰序列》

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《RNA干扰USE1基因慢病毒载体的构建及鉴定》


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根据NCBI数据库中USE1基因的mRNA序列(NM_023079),利用Invitrogen公司提供的BLOCK-iTTM RNAi Designer工具,设计靶向USE1基因的shRNA序列。选择5'端以G开头,GC值在35%-55%之间,且靶点序列起始位置不同的三条序列作为候选,如表1所示。根据慢病毒抑制表达载体pLL3.7的特点及要求,在寡核苷酸链最两端加上Bam H I和Xho I酶切位点,并在5'端加上重建U6启动子的T碱基,在shRNA序列后加上Loop环序列TTCAAGAGA,在3'端加上终止序列TTTTTT。