《表1 不同HCV亚型NS5A基因片段扩增引物及PCR条件》
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《静脉注射吸毒者HIV-1/HCV共感染的HCVNS5A抑制剂天然耐药相关变异分析》
2) NS5A基因序列扩增及分型:以cDNA为模板,参考实验室前期获得的基因亚型信息[11],采用巢式聚合酶链式反应(PCR)的方法分别对7个亚型样本的NS5A基因片段(H77:6258-7602)进行扩增。第一轮反应体系为25μL采用Takara公司TaKaRa Ex Taq试剂;提取第一轮反应产物5μL为模板,进行第二轮扩增,采用Tiangen公司的2×Taq PCR MasterMix试剂。不同HCV亚型的引物和PCR反应条件见表1。第2轮PCR产物经2%的琼脂糖凝胶电泳鉴定,扩增成功的样品送北京擎科公司纯化测序。获得的NS5A序列用Mega 6.0软件构建Neighor-joining (NJ)系统进化树确认分型。
图表编号 | XD0078499800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.26 |
作者 | 曾志君、戴洁、陈会超、董莉娟、杨敏、金晓媚、孙鹏艳、杨朝军、马艳玲、陈敏 |
绘制单位 | 云南省疾病预防控制中心性病艾滋病防制所、云南省疾病预防控制中心性病艾滋病防制所、云南省疾病预防控制中心性病艾滋病防制所、云南省疾病预防控制中心性病艾滋病防制所、云南省疾病预防控制中心性病艾滋病防制所、云南省疾病预防控制中心性病艾滋病防制所、云南省疾病预防控制中心性病艾滋病防制所、云南省疾病预防控制中心性病艾滋病防制所、云南省疾病预防控制中心性病艾滋病防制所、云南省疾病预防控制中心性病艾滋病防制所 |
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