《表1 巢式PCR扩增引物及片段长度》

《表1 巢式PCR扩增引物及片段长度》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《三个城市部分HIV感染者抗病毒治疗前耐药状况调查》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

2)巢式聚合酶链式反应(PCR)及基因测序:采用巢式PCR,针对高度保守序列pol基因反转录酶/蛋白酶区和整合酶区分别进行扩增,扩增引物详见表1,反应体系详见表2,扩增反应条件为:第一轮:50℃反转录30min;94℃预变性2min,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,40次循环;72℃延伸8min;4℃保温。第二轮:94℃预变性2min,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,40次循环;72℃延伸8min;4℃保温。将第二轮PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳鉴定,条带大小确定后进行脱氧核糖核酸(DNA)纯化并送至苏州金唯智公司测序,测序引物分别使用第二轮PCR中正义链引物。使用斯坦福大学HIV耐药数据库(http://hivdb.stanford.edu/)对测序结果进行序列比对,并根据斯坦福网站评分标准将HIV-1对每种抗反转录病毒药物的耐药程度分为5个等级:敏感、潜在低度耐药、低度耐药、中度耐药和高度耐药,计算低度以上耐药率并分析不同扩增区域的耐药相关突变特点。