《表1 靶点序列及shRNA序列》

《表1 靶点序列及shRNA序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《腺相关病毒介导shRNA敲减小鼠海马兴奋性氨基酸转运体3动物模型的构建》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

从GenBank数据库获取SLC1A1m RNA(编号:NM_009199.1)序列并筛选出4处靶点,使用Designer 3.0(Genepharma)软件设计4条效应shRNA模板DNA,命名为mSLC1A1-1、mSLC1A1-2、mSLC1A1-3、mSLC1A1-4;同时设计1条阴性对照shRNA模板,命名为NC(表1)。按设计序列合成OligoDNA,在退火液中按梯度退火后与经LguⅠ(SapⅠ)酶切线性化的AAV-GP-1(pAAV-U6-EGFP)载体质粒连接,转化DH5α大肠埃希菌挑取阳性克隆,经质粒抽提得5种重组质粒,命名为pAAV-GP-shRNA-SLC1A1-1-EGFP、pAAV-GP-shRNA-SLC1A1-2-EGFP、pAAV-GP-shRNA-SLC1A1-3-EGFP、pAAV-GP-shRNA-SLC1A1-4-EGFP、pAAV-GP-shRNA-NC-EGFP,送苏州金唯智科技有限公司测序鉴定。将测序正确的质粒与pHelper包装质粒、pAAV-DJ辅助质粒共转染AAV293细胞6 h,更换为完全培养基培养72 h,收集细胞和上清液,-80℃/37℃冻融3次,2 000 r/min离心5 min,取上清,密度梯度离心纯化后可得到5种rAAV,命名为rAAV-shRNA-SLC1A1-1-EGFP、rAAV-shRNA-SLC1A1-2-EGFP、rAAV-shRNA-SLC1A1-3-EGFP、rAAV-shRNA-SLC1A1-4-EGFP、rAAV-shRNA-NC-EGFP。将病毒液有限梯度稀释病毒液侵染293T细胞,荧光计数法测定病毒液滴度[9]。