《表3 枇杷EjWRKY基因特征分析》
在枇杷果实转录组测序研究的基础上,分离了33条具典型WRKY结构域的序列,长度分布在913~4 088 bp,分别命名为EjWRKY01~EjWRKY33。通过对氨基酸序列进行比对分析,并根据WRKY转录因子N–端WRKY保守结构域和C–端保守锌指基序的类型将枇杷33个WRKY蛋白分为3大类(图1),其中EjWRKY01、EjWRKY03、EjWRKY11、EjWRKY13、EjWRKY17和EjWRKY18共6个基因含有2个保守的WRKY结构域而划分为Ⅰ类。其中靠近N端的WRKY结构域命名为Ⅰ-N,其保守结构域长度在60个氨基酸左右,锌指结构均为C-X4-C-X22-HXH;靠近C端的WRKY结构域命名为Ⅰ-C,其锌指结构均为C-X4-C-X23-HXH。EjWRKY02、EjWRKY04、EjWRKY05和EjWRKY33等22个基因含有1个保守的WRKY结构域而划分为Ⅱ类,其锌指结构为C-X4-5-C-X23-HXH。EjWRKY15、EjWRKY21、EjWRKY24、EjWRKY25和EjWRKY30共5个基因具有1个保守的WRKY结构域而划分为Ⅲ类,其锌指结构为C-X7-C-X23-H-X1-C。另外,除常见的WRKYGQK结构域外,还发现EjWRKY23含WRKYGKK新类型,详见表3。
图表编号 | XD0061582600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.25 |
作者 | 李晓颖、徐红霞、陈俊伟 |
绘制单位 | 浙江省农业科学院园艺研究所、浙江省农业科学院园艺研究所、浙江省农业科学院园艺研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |