《表2 各数据库注释统计：枇杷果实坐果前后差异基因筛选》

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《枇杷果实坐果前后差异基因筛选》

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使用Trinity软件对测序数据进行de novo拼接，将有重叠的Reads连接成一个更长的序列，经过不断的延伸，拼接成转录本。根据序列相似性以及长度，挑选出最长的一条作为Unigene，作为后续分析的参考序列。共获得37 129个Unigene。使用常见数据库注释包括NR注释、COG/KOG功能注释、GO分类、Swiss-Prot、egg NOG、KEGG和Pfam。注释数量最多的是非冗余蛋白数据库，注释数量为31 089条，其中长度在300～1 000 bp的基因有12 565个，大于1 000 bp的基因有18 524个。注释数量最少的是Pfam蛋白质家族域数据库，仅有29个基因被注释（表2）。