《表6 差异表达基因KEGG pathway注释结果统计表》

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《口虾蛄青岛和舟山群体比较转录组研究》


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在基于KEGG Pathway的基础上,找出差异表达基因显著性富集的Pathway,将对基因的生物学功能有进一步的了解。将差异表达基因比对到KEGG上,6 782条Unigene共注释了257个代谢通路,其中显著富集通路有40个,主要是与消化和新陈代谢相关的通路(表6)。显著最为富集的通路为胰液分泌,其次是代谢通路途径,内质网蛋白加工等。差异表达基因注释最多的Pathway为代谢途径通路(metabolic pathways),包括氨基糖与核苷酸糖代谢(Amino sugar and nucleotide sugar metabolism)、精氨酸与脯氨酸代谢(Arginine and proline metabolism)、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢(Alanine,aspartate and glutamate metabolism)、核黄素代谢(Riboflavin metabolism)、果糖和甘露糖代谢(Fructose and mannose metabolism)、淀粉和蔗糖代谢(Starch and sucrose metabolism)、脂肪酸代谢(Fatty acid metabolism)、丙酸盐代谢(Propanoate metabolism)、酪氨酸代谢(Tyrosine metabolism)和花生四烯酸代谢(Arachidonic acid metabolism),PPAR信号通路(PPAR signaling pathway)和原发性免疫缺陷(Primary immunodeficiency),2个群体口虾蛄差异基因功能富集的不同可能是因为某些功能基因的突变引起,并最终产生了对环境适应性的差异。