《表3 差异表达基因富集前15的KEGG Pathways》

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《滇重楼根茎数字基因表达谱分析》


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滇重楼根茎1年生龄段(R1)和3年生龄段(R3)的差异表达基因KEGG的注释结果可以分为细胞过程、环境信息处理、遗传信息处理、代谢和生物系统五大类。其中,细胞过程包括34条内吞、15条过氧化物酶体和35条吞噬体共3小类84条代谢途径;环境信息处理只包括19条ABC转运和13条植物激素信号转导2个小类32条代谢途径;遗传信息处理包括96条内质网蛋白加工、384条核糖体、43条剪接、56条RNA运输等共计7个小类642条代谢途径;代谢包括139条碳代谢、105条氨基酸生物合成、63条乙醛酸和二羧酸代谢在内的共37小类1 223条代谢途径;生物系统仅包括1小类35条植物病原菌互作的代谢途径;3年生相对于1年生的滇重楼根茎的差异基因2 369条分布在117个通路中,按照差异程度从高到低排序,其中差异表达基因富集前20的Pathways(表3),可看出核糖体代谢通路中涉及差异程度最高,DEGs最多达384条,其次是光合生物固碳、乙醛酸盐代谢、泛素介导的蛋白水解等代谢通路。