《表1 PPR基因在各个物种中的分布 (Lurin et al., 2004)》

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《植物线粒体RNA编辑调控研究进展》

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注:PPR蛋白:Pentatricopeptide重复蛋白；DYW结构域:在其C端包含了天冬氨酸（D），酪氨酸（Y）和色氨酸（W）3个保守的氨基酸Note:PPR proteins:Pentatricopeptide repeat proteins；DYW domain:Containing three highly conserved amino acids D（aspartic acid），Y（tyrosine）

诸多研究发现植物中存在数量庞大的PPR基因，而动物中该家族基因的数量较少。目前的研究发现拟南芥和水稻的基因组中有400～500个PPR基因，而在人类和果蝇的基因组中PPR基因的数目极少，分别为6个和2个左右，PPR是真核生物特异的基因家族（表1），在原核生物种几乎没有，这似乎与植物的进化存在一定的关系（Lurin et al.，2004）。为了解PPR基因的起源与进化问题，Hattori等（2004）对相对古老的陆生苔藓植物小立碗藓（Physcomitrellapatens）进行了大量的研究，发现该物种中含有70～100个PPR基因，而在绿色藻类基因组数据库中仅发现1个PPR基因，因此关于PPR基因的起源与进化问题，目前仍不清晰。后来Lurin等（2004）对拟南芥中所有PPR蛋白的C末端的氨基酸序列进行比较分析，发现在其C末端通常含有3个保守的蛋白结构域，分别将其命名为E、E+和DYW结构域（Aubourg et al.，2000）。另外，这些PPR蛋白C末端的结构域排列方式存在一定规律，其顺序通常按照E、E+和DYW排列，且具有DYW结构的蛋白肯定有E和E+结构，而具有E+结构的蛋白质肯定有E结构（图1）。