《表2 Unigenes在Nr数据库中的物种分布》
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《PEG6000模拟干旱胁迫下银杏幼苗叶片的转录组分析》
将组装获得的转录组序列与六大数据库(NR,Swiss-Prot,Pfam,COG,GO和KEGG)进行比对,获得在各数据库的注释信息(图2)。在NR、Swiss-Prot、Pfam、COG,GO和KEGG数据库中分别注释了37 361、31 209、27 904、6 102、28 985和14 723个Unigenes。在NR数据库中注释的Unigenes物种分布情况中,其中与云杉同源的最多,有9 032条(24.41%),其次是无油樟2 644条(7.15%),注释与银杏同源的条数有431条(1.16%),说明银杏与云杉和无油樟同源性较高,其二者的遗传信息对银杏转录组的注释参考性较高(表2)。
图表编号 | XD00194384900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.28 |
作者 | 朱智博、郁万文、曹福亮、汪贵斌 |
绘制单位 | 南京林业大学南方现代林业协同创新中心、南京林业大学南方现代林业协同创新中心、南京林业大学南方现代林业协同创新中心、江苏省农业种质资源保护与利用平台、南京林业大学南方现代林业协同创新中心 |
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