《表3 部分葡萄新转录本在NR数据库中匹配到的不同物种》

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《基于RNA-Seq技术的葡萄不同花型新转录本预测和基因结构优化》

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将上述新转录本分别与COG、GO、KEGG、Swiss-Prot、NR等数据库进行序列比对，共得到697个新转录本的注释信息（图4）。进一步分析表明，从COG数据库获得的注释信息最少，仅有50条从NR和GO数据库获得的注释信息最多，分别为696和321条。其中NR数据库注释的696个新转录本中，有292个新转录本功能未知，且在NR数据库所注释的696个新转录本中有43个新转录本与黄瓜（Cucumis sativus）、拟南芥和亚麻荠（Camelina sativa）等25个其他物种相匹配（表3），为以后研究多物种同源性分析和近缘种基因组功能提供潜在的线索。