《表1 PCV3 Cap核苷酸序列相似性分析》

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《猪圆环病毒3型Cap蛋白的表达纯化及单克隆抗体的制备》

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1:China GDLC1（MF069115）；2:Demark（MG014377）；3:Italy（MF805719）；4:Korean（MF611878）；5:Spain（MF805720）；6:Sweden（MG765473）；7:Thailand（MG310152）；8:USA 2167（KX458235）；9:Brazil（MF079254）；10:China dog（KY363870）；11:China Jiangxi 47（KY354064）.

使用软件Mega7.0对PCV3 Cap基因进行遗传进化分析，结果表明，本研究中GDLC1株与其他地区参考毒株可分成2个进化分支，GDLC1株与宿主为猪的意大利、巴西、西班牙、美国、丹麦、泰国、韩国、瑞典株和宿主为犬的中国代表毒株在同一进化分支，而与中国江西代表株（宿主为猪）不在一个进化分支（图1）。使用软件DNAStar7.1对Cap基因进行核苷酸序列相似性分析和氨基酸位点突变分析。结果表明，GDLC1株与所有参考毒株的基因序列相似性较高，为96.9%~99.5%；其中，与巴西、西班牙和意大利的相似性最高，均为99.5%；与中国江西代表株相似性最低，为96.9%（表1）；GDLC1株与其他各国代表毒株相比，一共有16个氨基酸突变位点，其中有12处多肽位点相对稳定遗传（21、70、90、95、97、107、121、131、132、137、179、206），来自不同地区毒株间氨基酸序列差异不大（表2）。