《表1 SADS-CoV N基因的核苷酸序列相似性分析》

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《猪急性腹泻综合征冠状病毒核衣壳蛋白的原核表达及其多克隆抗体的制备》

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通过对来自于广东省12个规模化猪场病毒N基因的测序以及在NCBI上已公布的6株毒株（包含来自福建1株[7]，来自广东5株）N基因的序列比对发现序列几乎一致，同源性为99.6%～100%（见表1）。仅有来自广东的3株序列发生突变（见表2），分别为SEAV-GD01P2 (MF370205.1）：第716位核苷酸A突变为G，导致第239位氨基酸由Glu突变为Gly。PEAV-GD2017 (MG742313.1）：第716位核苷酸A突变为G，导致第239位氨基酸由Glu突变为Gly，以及第728位核苷酸G突变为T，导致第243位氨基酸由Arg突变为Leu。GD-LSN-1：第587位核苷酸G突变为A，导致第196位氨基酸由Ser突变为Asn以及第755位核苷酸C突变为T，导致第252位氨基酸由Ser突变为Phe。本课题组人员发现，SADS-CoV N蛋白序列与来自于蝙蝠的HKU2的同源性高达92.7%，推测可能由于N蛋白是SADS-CoV中相对比较保守的结构蛋白，所以目前该病毒N蛋白序列几乎一致。对N基因进行检测不能代表病毒变异性，在后续研究中应着重对S基因进行检测以了解SADS-CoV的遗传变异情况。