《表3 梯度引物浓度扩增CT值及扩增效率计算结果》
注:与3.3.1中的阴性对照相同,其体系为:模板为120 ng/μL、引物浓度为10μmol/L,其作用就是证明H2O等物质没有被DNA污染。k=En/E5,其中En表示第n个实验组的扩增效率,E5表示第5个实验组的扩增效率。
最优模板浓度确定后,使用模板浓度为120ng/μL,采用超微量紫外分光光度计测量β-actinF、β-actin-R引物浓度为10μmol/L,依次稀释为10μmol/L、5μmol/L、2.5μmol/L、1.25μmol/L、0.625μmol/L 5个浓度梯度,设置一个阴性对照,三个重复组,进行实时荧光定量PCR反应,对引物浓度进行优化检测,其扩增结果如图4所示。计算其扩增效率时因为模板浓度不变,即模板初始浓度X0都相同,所以E’/E1=(X1×2CT)/(X’×2CT’)=5(n-1)×2-△CT=2-△CT,结合计算和浓度梯度的扩增曲线,当引物浓度为10μmol/L时,得到的扩增曲线最好,模板扩增效率最高,因此引物最优浓度为10μmol/L,如表3所示。
图表编号 | XD0043244700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.01 |
作者 | 张小海、罗飞、王广、张莹、左天、张绍鹏 |
绘制单位 | 武汉轻工大学生物与制药工程学院、武汉轻工大学生物与制药工程学院、武汉轻工大学生物与制药工程学院、武汉轻工大学生物与制药工程学院、武汉轻工大学生物与制药工程学院、武汉轻工大学生物与制药工程学院 |
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