《表1 MSAP接头:运用MSAP技术测定谷子基因组DNA胞嘧啶甲基化水平》

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《运用MSAP技术测定谷子基因组DNA胞嘧啶甲基化水平》


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分别用Eco RⅠ/HpaⅡ、Eco RⅠ/MspⅠ组合对基因组DNA进行酶切,连接接头(表1),实验所用酶购买自NEB公司,所用引物序列由生工生物工程(上海)股份有限公司合成(表2)。每对引物进行5%的聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染后对清晰可辨、可重复的带型进行记录,并对其位点进行MSAP分析。实验根据泳道内有无条带,将清晰可重复的条带记为“1”,同一位置没有条带记为“0”。统计每对引物扩增出的总条带数和其中的甲基化条带数,每个引物组合做3次重复。