《表1 MSAP所用的引物和接头序列》

《表1 MSAP所用的引物和接头序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《广藿香DNA甲基化水平与其主要化学成分含量的相关性研究》


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用植物DNA提取试剂盒提取DNA,通过0.8%琼脂糖凝胶电泳和超微量紫外分光光度计检测DNA的质量、浓度与纯度。提取之后,稀释至20 ng/μL,-20℃保存。随后根据文献[13]的方法做适当修改后进行酶切、连接和PCR扩增。所使用的10对选择性扩增引物(如表1所示)来自黄洁燕[14]对广藿香的MSAP的引物筛选结果。选择性扩增的产物经变性后,取5μL样品进行6%变性聚丙烯酰胺电泳,之后银染并拍照,使用Quantity One 4.62对电泳图片背景降噪后统计条带并分析。根据某一条带在EcoRⅠ-HpaⅡ与Eco RⅠ-MspⅠ组合的出现与否,将条带分为4种类型:类型(1),在Eco RⅠ-MspⅠ(E-M)与Eco RⅠ-HpaⅡ(E-H)中同时出现,代表了该位点是非甲基化位点;类型(2),在E-M中出现,而在E-H中没有出现,代表了该位点发生了内部胞嘧啶的全甲基化或半甲基化,下文称为“全甲基化”;类型(3)在E-M中没有出现,而在E-H中出现,代表了该位点发生了外部胞嘧啶的半甲基化,下文称“半甲基化”;类型(4)在E-M与E-H中都没有出现,代表该位点发生了超甲基化或者条带缺失。为方便后续分析及减少统计错误率,本研究中仅考虑前3种类型。