《表2 不同物种KASII蛋白信息》

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《杜氏盐藻β-酮酯酰-ACP合酶(DsKASⅡ)基因的分离及功能分析》


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使用Genedoc软件对不同物种的KASII蛋白(表2)的氨基酸序列进行多序列比对(图3)显示,这些蛋白序列相似性较高。经BLAST分析发现,杜氏盐藻KASII与团藻(Volvox carteri f.nagariensis)和莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)KASII蛋白序列同源性分别为74%和73%,与水稻(Oryza sativa)、拟南芥的KASII蛋白序列同源性仅为60%左右。不同物种KASII蛋白的功能区比较保守,肽链C端具有较高的相似性,而N端差异性较大。ExPASy-PRO-SITE分析显示DsKASII有一个酶催化活性位点,位于219~235区间(GPNYSISTACATGNYCI),最关键的酶活位点为228位的半胱氨酸(Cys)(图4) 。使用MAGA7对不同物种的KASII序列进行比对,构建系统发育树(图5)。结果表明,这些KASII蛋白可明显的分为两大类,即陆生植物和藻类两个类群。杜氏盐藻DsKASII与莱茵衣藻、团藻、盘藻(Gonium pectorale)的亲缘关系较近。