《表3 实时荧光定量PCR特异性引物序列及探针》

《表3 实时荧光定量PCR特异性引物序列及探针》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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按照粪便DNA提取试剂盒(Omega,美国)说明书提取直肠粪便中的DNA,利用荧光定量PCR仪(CFX96,Bio-Rad,美国)测定其总菌、大肠杆菌、乳酸杆菌、双歧杆菌和芽孢杆菌的数量。根据细菌的16S rRNA基因序列设计相应的特异性引物(表3)。参照刁慧[15]的方法,应用Taqman探针进行荧光定量PCR,利用Real Master Mix探针[天根生化科技(北京)有限公司,中国]进行检测。大肠杆菌、乳酸杆菌和芽孢杆菌的反应体系包括:8μL Real Master Mix、1μL Probe Ehancer Solution、上游和下游引物各1μL、0.3μL探针、1μL DNA和7.7μL ddH2O;双歧杆菌的反应体系包括:8μL Real Master Mix、1μL Probe Ehancer Solution、上游和下游引物各1μL、0.8μL探针、1μL DNA和7.2μL ddH2O。采用三步法扩增标准程序:95℃预变性10 s,95℃5 s,50~60℃25 s,95℃10 s,共50个循环。总菌反应体系为25μL:SYBR Premix Ex TaqTMⅡ12.5μL、上游和下游引物各1μL、DNA 1μL和ddH2O 9.5μL。采用三步法PCR扩增标准程序:95℃预变性10 s,95℃5 s,50~60℃25 s,95℃10 s,熔解曲线条件为95℃39 s、55℃1 min、95℃1 min,共40个循环。以每克内容物为检测单位,计算方法参照Qi等[16],结果用每克内容物中菌落形成单位(CFU)的常用对数[lg(CFU/g)]表示。