《表1 引物及探针序列:实时荧光PCR法鉴定食用淀粉植物来源》

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《实时荧光PCR法鉴定食用淀粉植物来源》


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真核生物、木薯、马铃薯、大米、玉米以及小麦特异性引物及探针来自文献[10]~[14],红薯、藕、山药、葛根特异性引物探针均为自行设计。采用Clustal W软件比对NCBI数据库中木薯(GenBank.FN551838.1)、红薯(GenBank.EF119215.1)、马铃薯(GenBank.NM_001288415.1)的甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,g3pdh)基因序列,根据序列差异性区域设计红薯特异性引物及探针;根据藕(DQ105985.1)、番薯(KC621864.1)、芋头(JN105678.2)、马铃薯(KF022370.1)、木薯(AB441756.1)的ITS1-5.8S-ITS2基因序列比对结果设计藕特异性引物与探针;根据山药(JF972919.1)、番薯(AY100962.1)、木薯(AB233880.1)、马铃薯(KJ652187.1)核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶(ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase,rbcL)基因序列比对结果设计山药特异性引物与探针;根据葛根(D63577.1)、番薯(JN083840.1)、马铃薯(HQ659497.1)查尔酮异构酶(chalconeflavanoneisomerase,CHI)基因序列比对结果设计葛根特异性引物与探针(见表1)。所有引物探针由上海英骏生物技术有限公司合成。