《表2常用虚拟筛选软件：计算机辅助药物设计用于化妆品植物源功效原料筛选的建议》

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《计算机辅助药物设计用于化妆品植物源功效原料筛选的建议》

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虚拟筛选的方法主要有三种:分子对接（Molecular docking）、药效团匹配（Pharmacophore）及小分子结构相似性（Small molecular shape similarity）[21]。三种方法的理论基础应用范围均有不同，而且也有各自的优缺点，但综合归纳来看，其基础理论均是对天然化合物及靶点蛋白直接的结合能力的评估分析，通过模拟和计算受体与配体的这种相互作用，进行先导化合物的优化与设计。分子对接是通过受体自身的特征以及与配体分子之间的相互作用模式来进行药物设计，其理论依据的基础是配体受体之间结合的锁匙模型（Lock and key principle）。通过计算二者之间的静电作用、氢键作用、疏水作用、分子间作用力等来预测两者间的结合模式和亲和力，从而进行药物的虚拟筛选。药效团泛指药物小分子中对活性起重要作用的药效特征元素的空间排列形式，主要包括:氢键供体、氢键受体、正负电荷中心、芳环中心、疏水基团、亲水基团以及几何构象体积冲撞。根据对于这些药效特征元素的归纳总结进而推断，能够预测待测小分子的生物活性。小分子结构相似性是通过对于具有相同机制的化合物进行定量构象关系研究，再进行化合物数据库搜索，本质上是一种数据库搜索技术。常用的三种筛选方法软件及其特点详见表2。