《表3 虫荧光素酶活性区域的氨基酸组成》

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《萤火虫Luc基因的克隆及生物信息学分析》

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如图2所示，以6q2m.1的A链为模板建模，虫荧光素酶与模板序列一致性为70.32%，相似度为0.51，覆盖度为0.98，预测其功能为荧光素4-单加氧酶。这次构建模型的总体评价为0.85，Qmean为-0.75。Ramachandran评估结果表明同源建模显示氨基酸位点都位于最佳区域内的占97.4%（522/536），氨基酸位点位于允许区域范围内的占99.8%（535/536），说明该模型准确可靠（图3）。如图4所示，3DLigand Site以PDB ID 4kk2的B链作为折叠子，发现虫荧光素酶有Mg2+、AMP、ATP等多个配体结合位点。根据Cast P分析结果，虫荧光素酶的活性区域由125个氨基酸残基构成，活性区域的面积和体积分别为2 483.8792和1 834.4543（表3，图5）。