《表1 牛大力淀粉酶理化特征》

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《牛大力淀粉酶基因家族的生物信息学分析》


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基于牛大力根系转录组测序结果,搜索到注释为淀粉酶基因的unigene共有28条,然后分别经ORF Finder和CDS Search确认具有完整开放阅读框ORF,最后共鉴定到28条牛大力淀粉酶unigene,命名为Ms Am1到Ms Am28(表1),ORF Finder在线预测其编码的淀粉酶前体氨基酸数目最少的为Ms Am28 (256个),最大的为Ms Am12(4 141个)。利用Ex PAsy在线软件对牛大力淀粉酶基因编码的蛋白质进行理化性质预测结果见表1,牛大力淀粉酶的分子量在20.78~349.39 k Da之间,均为酸性蛋白质,带正电残基(Arg+Lys)和带负电残基(Asp+Glu)均为0;不稳定系数显示Ms Am1、Ms Am8、Ms Am15、Ms Am16、Ms Am18、Ms Am21、Ms Am25、Ms Am27、Ms Am28为稳定蛋白,其余为不稳定蛋白;总平均亲水性及脂肪指数显示该家族蛋白均属于亲水性蛋白。