《表2 马铃薯St Igt基因家族信息》

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《马铃薯StIgt基因家族的鉴定及其对干旱胁迫的响应分析》

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利用生物信息学方法通过双向BLAST分析，从马铃薯‘DM-v4.03’全基因组中共筛选到了21个St Igt备选序列，通过局部BLASTP并删除重复序列后，保留15个序列，提交CDD、Pfam确认蛋白结构域。再将这15条序列与已在拟南芥、李属植物、水稻、玉米等其他作物中报道的Igt基因序列进行同源比对（表1），最后在马铃薯中共确定了10个St Igt家族成员（表2）。由表2可知，马铃薯中St Igt家族蛋白长度范围从110 （St Igt10）到283个氨基酸（St Igt1）不等，分子量介于13.136 k D （St Igt10）和32.542k D （St Igt1）之间，预测等电点为3.82 （St Igt4）～9.86（St Igt10）。大多数St Igt蛋白（90%）的等电点小于7.0，推测其可能是一类酸性蛋白。为进一步了解St Igt基因家族成员之间的同源关系，本研究利用拟南芥、辣椒、水稻和玉米中已研究的Igt基因共同构建了Igts的系统进化树，聚类为3个亚族:Lazy1 （I）、Tac1 （II）和Dro1 （III），分别含有4、4、2个St Igt基因（图1）。